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西南大學科研團隊繪就家蠶超級泛基因組圖譜

發布時間:2022-10-10 作者:胡航宇 來源:中國教育新聞網

中國教育報-中國教育新聞網訊(記者 胡航宇)10月9日,西南大學發布最新科研成果,家蠶基因組生物學國家重點實驗室團隊歷時四年,完成家蠶大規模種質資源基因組解析(“千蠶基因組”),繪就家蠶超級泛基因組圖譜。該研究在世界上率先實現家蠶基因庫數字化,創建“數字家蠶”,對于深化功能基因組研究和推進家蠶模式化,開啟家蠶設計育種,賦能“改造家蠶、多元利用”等,將產生深遠的影響。

家蠶是重要的經濟昆蟲和新興模式生物,但之前僅有單一參考基因組及部分重測序,尚不足以支撐基因組變異和優良基因的深度挖掘。家蠶基因組生物學國家重點實驗室主任、國家蠶桑產業技術體系首席科學家代方銀教授介紹,研究團隊對1078份蠶種質資源(205份地方種,194份改良種,632份遺傳材料,47份野桑蠶)進行了深度測序,產生55.57T基因組數據,組裝了545個蠶的高質量基因組,對100個基因組進行了基因注釋,鑒定到4300余萬個SNP、930余萬個InDel、340余萬個結構變異(SV)和7308個新基因(家族),繪制了一個高精度家蠶泛基因組圖譜。

該超級泛基因組囊括了目前最全面的家蠶和野桑蠶基因組信息,是迄今全球動植物領域最大的長讀長泛基因組。同時,對蠶的各種遺傳變異、群體結構、人工選擇和生態適應性及經濟性狀開展了深入的研究,取得豐碩的創新結果。其研究論文于今年9月24日在國際名刊《自然通信》(Nature Communications)在線發表。

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